MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lacinutrix sp. 5H-3-7-4 chromosome

Total Repeats: 8112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015638	A	7	7	1951	1957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015638	T	8	8	4785	4792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015638	ACA	2	6	4843	4848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015638	T	7	7	4849	4855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015638	ATT	2	6	8141	8146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015638	GCA	2	6	8147	8152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015638	ATTT	2	8	8170	8177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015638	TTG	2	6	8178	8183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015638	A	7	7	8219	8225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015638	TTA	2	6	8244	8249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015638	CTAAA	2	10	8253	8262	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015638	TAA	4	12	9682	9693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015638	T	6	6	9726	9731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015638	A	6	6	9776	9781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015638	ATAA	2	8	9806	9813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015638	AAC	2	6	9835	9840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015638	AC	3	6	9839	9844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015638	T	6	6	11319	11324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015638	A	7	7	11327	11333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015638	ATA	2	6	11348	11353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015638	TA	4	8	11361	11368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015638	TAT	2	6	11394	11399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015638	AT	4	8	11398	11405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015638	ATT	2	6	11421	11426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015638	T	6	6	11425	11430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015638	TTA	2	6	11456	11461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015638	TTAAAA	2	12	12109	12120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015638	T	9	9	12142	12150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015638	TAAAG	2	10	12161	12170	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015638	ATT	2	6	13008	13013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015638	AGAA	2	8	13073	13080	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015638	TTA	2	6	13428	13433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015638	TAT	2	6	13438	13443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015638	A	6	6	14625	14630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015638	T	6	6	14649	14654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015638	A	8	8	14670	14677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015638	TTA	3	9	14692	14700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015638	AGC	2	6	14739	14744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015638	ATTTA	2	10	14745	14754	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015638	AAG	2	6	14770	14775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015638	T	6	6	16023	16028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015638	A	6	6	16038	16043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015638	GTT	2	6	16128	16133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015638	TGT	2	6	16201	16206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015638	AAT	2	6	16215	16220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015638	ATAA	2	8	16227	16234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015638	CTTT	2	8	16594	16601	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015638	TAA	2	6	16627	16632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015638	TTA	2	6	16647	16652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015638	TAA	2	6	16661	16666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015638	ATAA	2	8	16687	16694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015638	TAA	2	6	16700	16705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015638	TTAT	2	8	16723	16730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015638	AAC	2	6	16749	16754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015638	TTA	2	6	16809	16814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015638	A	6	6	16831	16836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015638	TATT	2	8	16842	16849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015638	T	6	6	16851	16856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015638	TGTA	2	8	16873	16880	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015638	AGT	2	6	16966	16971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015638	AAAT	2	8	17013	17020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015638	AAAAT	2	10	17029	17038	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015638	AT	3	6	17037	17042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015638	GATT	2	8	17175	17182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015638	TAAA	2	8	17193	17200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015638	A	6	6	17217	17222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015638	ATA	2	6	17226	17231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015638	TAT	2	6	17246	17251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015638	TTTTA	2	10	17260	17269	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015638	TTA	2	6	17289	17294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015638	ATT	2	6	17921	17926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015638	TAA	2	6	17931	17936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015638	A	6	6	17997	18002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015638	TAT	2	6	18048	18053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015638	TAT	2	6	20311	20316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015638	A	7	7	20317	20323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015638	A	6	6	20365	20370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015638	ATTA	2	8	20377	20384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015638	ATTAT	2	10	20390	20399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015638	AAT	2	6	20406	20411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015638	TATAAT	2	12	20444	20455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015638	AAT	2	6	20495	20500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015638	TAAA	2	8	20509	20516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015638	TA	3	6	20551	20556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015638	TCT	2	6	20565	20570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015638	A	8	8	20576	20583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015638	T	7	7	20613	20619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015638	ATA	2	6	23544	23549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015638	TTAGTT	2	12	23550	23561	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015638	CAA	2	6	23582	23587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015638	ATA	2	6	23604	23609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015638	T	8	8	23622	23629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015638	A	7	7	23640	23646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015638	A	7	7	24712	24718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015638	TAT	2	6	25981	25986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015638	T	6	6	26005	26010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015638	T	8	8	26045	26052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015638	A	8	8	26066	26073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015638	T	6	6	26102	26107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015638	TTTA	2	8	26161	26168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015638	T	8	8	29449	29456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015638	CAA	2	6	29466	29471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015638	A	8	8	29470	29477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015638	CTA	2	6	29486	29491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015638	A	6	6	31116	31121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015638	A	9	9	31182	31190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015638	A	6	6	31220	31225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015638	CGA	2	6	31228	31233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015638	GTA	2	6	31251	31256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015638	GTAT	2	8	31341	31348	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015638	AAT	2	6	31349	31354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015638	TA	3	6	31367	31372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015638	A	6	6	31383	31388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015638	ATA	2	6	31411	31416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015638	TAA	3	9	31419	31427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015638	TAA	2	6	31437	31442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015638	A	7	7	31441	31447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015638	TTA	2	6	31471	31476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015638	TGG	2	6	31566	31571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015638	AAC	2	6	31640	31645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015638	TAGA	2	8	31721	31728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015638	ACG	2	6	31743	31748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015638	C	7	7	31849	31855	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_015638	ACC	2	6	31938	31943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_015638	TC	3	6	31985	31990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015638	ACC	2	6	32082	32087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_015638	GGT	2	6	32150	32155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015638	CAA	2	6	32160	32165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015638	TGC	2	6	32187	32192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015638	TAC	2	6	32305	32310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015638	GCC	2	6	32420	32425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_015638	AAC	2	6	32463	32468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015638	TC	3	6	32647	32652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015638	GCT	2	6	32703	32708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015638	ACTA	2	8	32818	32825	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015638	TGT	2	6	32872	32877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015638	ATT	2	6	33114	33119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015638	GCT	2	6	33173	33178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015638	AT	3	6	33234	33239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015638	CTG	2	6	33308	33313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015638	TCC	2	6	33520	33525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_015638	TAC	2	6	33535	33540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015638	ACT	2	6	33586	33591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015638	TC	3	6	33808	33813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015638	ACT	2	6	33875	33880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015638	TCA	2	6	33960	33965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_015638	TCGC	2	8	34034	34041	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_015638	ACT	2	6	34043	34048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015638	TCT	2	6	34068	34073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015638	CCT	2	6	34111	34116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_015638	T	6	6	34283	34288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015638	AGC	2	6	34308	34313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_015638	ACTA	2	8	34319	34326	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_015638	TTA	3	9	34335	34343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015638	T	6	6	34387	34392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015638	CCT	2	6	34459	34464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_015638	AGGC	2	8	34472	34479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
158	NC_015638	ATT	2	6	34506	34511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015638	ATT	2	6	34540	34545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015638	T	6	6	34572	34577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015638	TAG	2	6	34582	34587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015638	TAG	2	6	34589	34594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015638	CTA	2	6	34666	34671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_015638	CAG	2	6	34690	34695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_015638	T	6	6	34708	34713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015638	GTC	2	6	34734	34739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_015638	AGG	2	6	34751	34756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_015638	CT	3	6	35027	35032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
173	NC_015638	GT	3	6	35052	35057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
174	NC_015638	TGA	2	6	35078	35083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_015638	AAC	2	6	35161	35166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_015638	GAC	2	6	35217	35222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_015638	GCA	2	6	35229	35234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_015638	GAA	2	6	35250	35255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
179	NC_015638	ATC	2	6	35312	35317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_015638	ATT	2	6	35531	35536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_015638	CTACA	2	10	35589	35598	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
182	NC_015638	ACT	2	6	35606	35611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_015638	ATA	2	6	35614	35619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_015638	TCC	2	6	35735	35740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
185	NC_015638	GCT	2	6	35752	35757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_015638	TTC	2	6	35819	35824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_015638	CTG	2	6	35915	35920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_015638	CTAT	2	8	35983	35990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
189	NC_015638	ATC	2	6	36065	36070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_015638	GTC	2	6	36171	36176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NC_015638	AAC	2	6	36300	36305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
193	NC_015638	AATT	2	8	36312	36319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_015638	TTGT	2	8	36343	36350	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
195	NC_015638	TCAAT	2	10	36383	36392	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_015638	T	6	6	36469	36474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_015638	T	8	8	36497	36504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_015638	A	6	6	36533	36538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_015638	T	7	7	36634	36640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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207	NC_015638	T	7	7	36658	36664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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217	NC_015638	TTAA	2	8	36899	36906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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230	NC_015638	TAA	2	6	39666	39671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
231	NC_015638	ATT	2	6	39944	39949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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237	NC_015638	TTA	2	6	40515	40520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_015638	A	7	7	46970	46976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_015638	T	10	10	56743	56752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_015638	T	9	9	56902	56910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_015638	AAAT	2	8	62428	62435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_015638	T	6	6	63331	63336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_015638	TAA	2	6	63342	63347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_015638	TTC	2	6	63353	63358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_015638	A	7	7	63380	63386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_015638	TCC	2	6	64114	64119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
290	NC_015638	A	6	6	64154	64159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015638	A	8	8	64170	64177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015638	A	6	6	64194	64199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015638	T	8	8	64220	64227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015638	A	8	8	64274	64281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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